Die heutige Biosphärenreservatsverwaltung wurde 1998 für die Betreuung des Schutzgebietssystems Elbetal eingerichtet. Seit 2005 ist die Biosphärenreservatsverwaltung eine eigenständige, unmittelbar dem niedersächsischen Umweltministerium zugeordnete Landesbehörde.

Aufgabenschwerpunkte liegen u.a. in der Entwicklung und Förderung nachhaltiger Landnutzungsformen und Wirtschaftsstrukturen, der Bewahrung der biologischen Vielfalt, der Erhaltung und Entwicklung der Kulturlandschaft, in der Öffentlichkeitsarbeit sowie in der Umweltbildung und Forschung.